Tomáš prichádza na oddelenie ONK (Oddelenie násilnej kriminality) na miesto, ktoré mu vybavil otec – súdny patológ (Anton Vaculík). Okrem Tomáša na oddelení pracujú pod vedením Ivana Tomečka v jeho tíme aj dvaja kriminalisti, dva protiklady, ktoré sa navzájom dopĺňajú: Oliver (Laco Hrušovský) a Sergej (Róbert Jakab). Ďalší je Rudo (Ivan Vojtek st.), ktorý dokáže získať akékoľvek informácie bez toho, aby vyšiel na ulicu. Na oddelení v rámci inovácie vyšetrovacích postupov pracuje aj psychologička a analytička Jana (Soňa Norisová). Šéfom celého oddelenia je Milan (Ivan Romančík). Popri vyšetrovaní zločinov sa odhaľuje aj privátny život dvoch hlavných predstaviteľov Ivana a Tomáša. Ivan má problém s dospievajúcou dcérou, a ten sa prenáša do jeho vzťahu k manželke. Tomáš sa zasa nasťahuje do spoločného bytu s priateľkou Luciou (Jana Knapíková), ktorá je novinárka a spoločne sa učia žiť spolu. Popritom má Tomáš naštrbený vzťah s otcom, s ktorým sa stretáva v práci – vyčíta mu jeho workoholizmus a obviňuje ho z matkinho úrazu, po ktorom ostala na vozíku. Mesto tieňov je prvý pôvodný kriminálny slovenský seriál. Na jeho príprave a realizácii tvorcovia spolupracovali so súdnymi lekármi a policajnými expertmi. Tí boli prítomní aj "na pľaci" počas samotného nakrúcania. Seriál má 10 častí a ich dej je inšpirovaný skutočnými kriminálnymi príbehmi, ktoré sa reálne odohrali. Oficiální text distributora.